MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Nostoc sp. PCC 7120 plasmid pCC7120delta

Total Repeats: 286

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003273	ATG	2	6	19	24	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_003273	CCA	2	6	30	35	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_003273	A	8	8	103	110	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_003273	ACC	3	9	118	126	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_003273	AGT	2	6	1352	1357	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_003273	TCA	2	6	1359	1364	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_003273	TGG	2	6	1367	1372	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_003273	ATG	2	6	1425	1430	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_003273	ACT	2	6	1557	1562	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_003273	A	6	6	1612	1617	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_003273	TCC	2	6	1622	1627	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12	NC_003273	TGT	2	6	1870	1875	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_003273	AT	3	6	1878	1883	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_003273	T	7	7	1901	1907	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_003273	T	6	6	2276	2281	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_003273	CAC	2	6	2311	2316	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17	NC_003273	CTT	2	6	2368	2373	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_003273	TA	3	6	2398	2403	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_003273	GTA	2	6	2412	2417	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_003273	TGAT	2	8	2457	2464	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_003273	AAC	2	6	2507	2512	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_003273	AAC	2	6	2527	2532	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_003273	T	6	6	2549	2554	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_003273	TC	3	6	2647	2652	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_003273	ATT	2	6	2730	2735	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_003273	AGA	2	6	2988	2993	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_003273	TA	3	6	3025	3030	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_003273	GAT	2	6	4855	4860	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_003273	ATG	2	6	4864	4869	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_003273	CAT	2	6	4953	4958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_003273	GTT	2	6	5066	5071	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_003273	GAA	2	6	5075	5080	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_003273	AG	3	6	6964	6969	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_003273	AAT	2	6	7004	7009	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_003273	A	8	8	7079	7086	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_003273	CAG	2	6	8647	8652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_003273	CTT	2	6	8653	8658	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_003273	GGC	2	6	8666	8671	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_003273	ACAGCA	2	12	8682	8693	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_003273	GAT	2	6	8698	8703	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_003273	T	6	6	8722	8727	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_003273	ATAA	2	8	9482	9489	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_003273	ATT	2	6	9492	9497	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_003273	T	8	8	9538	9545	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_003273	AAAT	2	8	9591	9598	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_003273	T	7	7	9607	9613	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_003273	CAG	2	6	9669	9674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_003273	GAT	2	6	9678	9683	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_003273	AT	3	6	9719	9724	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_003273	T	6	6	9752	9757	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_003273	T	7	7	9791	9797	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_003273	T	6	6	9804	9809	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_003273	A	6	6	10216	10221	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_003273	CA	3	6	10625	10630	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_003273	TTA	2	6	10948	10953	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_003273	T	6	6	10980	10985	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_003273	GTA	2	6	10986	10991	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_003273	TAG	2	6	11006	11011	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_003273	T	6	6	11014	11019	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_003273	TAT	2	6	11026	11031	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_003273	A	6	6	11053	11058	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_003273	T	6	6	11069	11074	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_003273	T	6	6	11097	11102	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_003273	CTT	2	6	11180	11185	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_003273	TGGCA	2	10	11271	11280	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
66	NC_003273	A	6	6	11303	11308	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_003273	CAG	2	6	11356	11361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_003273	CT	3	6	11398	11403	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NC_003273	G	6	6	12132	12137	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
70	NC_003273	G	6	6	12144	12149	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
71	NC_003273	T	6	6	12228	12233	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_003273	GGT	2	6	12242	12247	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_003273	GCT	2	6	12278	12283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_003273	CTTTA	2	10	12522	12531	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
75	NC_003273	TCA	2	6	12543	12548	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_003273	ACTC	2	8	12633	12640	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_003273	TTTC	2	8	12643	12650	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
78	NC_003273	ACT	2	6	13167	13172	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_003273	TAC	2	6	13183	13188	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_003273	AT	3	6	13202	13207	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_003273	GCTT	2	8	13218	13225	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
82	NC_003273	TA	3	6	13237	13242	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_003273	CA	3	6	13278	13283	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
84	NC_003273	TGT	2	6	13298	13303	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_003273	AG	3	6	13411	13416	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_003273	CTCAGT	2	12	13513	13524	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_003273	TCC	2	6	16045	16050	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
88	NC_003273	GGA	2	6	16063	16068	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_003273	ATT	2	6	16211	16216	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_003273	GGC	2	6	16218	16223	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_003273	ATG	2	6	17049	17054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_003273	T	6	6	17101	17106	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_003273	CTAT	2	8	17116	17123	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
94	NC_003273	GTA	2	6	17357	17362	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_003273	ATT	2	6	17391	17396	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_003273	ATC	2	6	17425	17430	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_003273	CAA	2	6	17449	17454	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_003273	AAT	2	6	17566	17571	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_003273	AAC	2	6	19607	19612	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_003273	AC	3	6	19709	19714	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
101	NC_003273	GA	3	6	20740	20745	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
102	NC_003273	AAG	2	6	20775	20780	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_003273	T	6	6	23130	23135	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_003273	CAG	2	6	23200	23205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_003273	AAT	2	6	23263	23268	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_003273	TAT	2	6	23292	23297	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_003273	AGA	2	6	23299	23304	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_003273	GAACT	2	10	24053	24062	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
109	NC_003273	AGA	2	6	25059	25064	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_003273	ATT	2	6	25255	25260	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_003273	TTAC	2	8	25328	25335	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
112	NC_003273	CCT	2	6	25367	25372	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
113	NC_003273	TGG	2	6	25403	25408	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
114	NC_003273	TGT	2	6	25441	25446	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_003273	CAG	2	6	25449	25454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_003273	TCA	2	6	25458	25463	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_003273	A	7	7	25497	25503	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_003273	AAT	2	6	26551	26556	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_003273	ATT	2	6	26665	26670	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_003273	TAA	2	6	26671	26676	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_003273	CTAA	2	8	26713	26720	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
122	NC_003273	GAT	2	6	26726	26731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_003273	CTG	2	6	26813	26818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_003273	AG	3	6	26824	26829	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
125	NC_003273	TAT	2	6	27599	27604	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_003273	TCT	2	6	27672	27677	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_003273	AC	4	8	27718	27725	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
128	NC_003273	GA	3	6	27726	27731	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
129	NC_003273	T	6	6	27765	27770	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_003273	AT	3	6	27785	27790	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_003273	CGA	2	6	28041	28046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_003273	TCC	2	6	28050	28055	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
133	NC_003273	ATC	2	6	28124	28129	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_003273	CTT	2	6	28177	28182	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_003273	TAA	2	6	28283	28288	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_003273	ACTT	2	8	28292	28299	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
137	NC_003273	AAG	2	6	28300	28305	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_003273	CTA	2	6	28657	28662	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_003273	ATT	2	6	28668	28673	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_003273	TCA	2	6	28675	28680	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_003273	ATTC	2	8	28714	28721	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
142	NC_003273	AAT	3	9	28730	28738	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_003273	TC	3	6	28774	28779	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
144	NC_003273	TTTA	2	8	28800	28807	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_003273	ATTC	2	8	29488	29495	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
146	NC_003273	AAT	3	9	29504	29512	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_003273	AT	3	6	29630	29635	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_003273	AGT	2	6	29640	29645	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
149	NC_003273	A	6	6	30035	30040	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_003273	TGGA	2	8	30775	30782	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
151	NC_003273	GAGT	2	8	30833	30840	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
152	NC_003273	TA	3	6	30899	30904	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_003273	AT	3	6	30970	30975	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_003273	TAA	2	6	31234	31239	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_003273	AAT	2	6	31378	31383	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_003273	CTT	2	6	31386	31391	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
157	NC_003273	A	6	6	31507	31512	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
158	NC_003273	AAT	2	6	31522	31527	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
159	NC_003273	AAT	2	6	32254	32259	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
160	NC_003273	ATA	2	6	32263	32268	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
161	NC_003273	GT	3	6	32277	32282	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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163	NC_003273	TAT	2	6	32330	32335	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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165	NC_003273	GCT	2	6	33165	33170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
166	NC_003273	TTG	2	6	33189	33194	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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168	NC_003273	ACT	2	6	35378	35383	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
169	NC_003273	TCA	2	6	35416	35421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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172	NC_003273	T	6	6	35651	35656	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
173	NC_003273	AATGT	2	10	35681	35690	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
174	NC_003273	TA	4	8	35753	35760	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
175	NC_003273	TATC	2	8	35810	35817	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
176	NC_003273	TATT	2	8	35834	35841	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
177	NC_003273	TTTA	2	8	35845	35852	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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183	NC_003273	TTA	2	6	36529	36534	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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186	NC_003273	ATT	3	9	37472	37480	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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188	NC_003273	T	8	8	37834	37841	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
189	NC_003273	GCA	2	6	37870	37875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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195	NC_003273	TAA	2	6	38855	38860	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
196	NC_003273	TAT	2	6	38882	38887	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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283	NC_003273	AAT	2	6	54529	54534	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
284	NC_003273	A	8	8	54604	54611	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
285	NC_003273	TAT	2	6	55389	55394	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
286	NC_003273	ATT	2	6	55400	55405	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.